在許多進水條件下，采用離子交換樹脂或反滲透膜技術均可。但工藝的選擇應由經濟性比較而定，一般情況下，含鹽量越高，反滲透就越經濟，含鹽量越低，離子交換就越經濟。

由于反滲透技術的大量普及，以下的組合工藝是更為合理的水處理方案：

1、采用反滲透+離子交換工藝或多級反滲透

2、反滲透+其它深度除鹽技術的組合工藝

以上只是個籠統的介紹，反滲透RO系統的設計還需根據實際情況而定，如進水水質是多少，對產水的水質、產水量，還有電導率各個方面有什么要求。

反滲透膜是反滲透RO系統的核心部件，一般情況下，需根據原水水質選擇膜元件（純水膜,超低壓純水膜,海水淡化膜,中水回用膜,耐高溫消毒膜,納濾膜）。

離子交換法處理：

優點：

1、預處理要求簡單、工藝成熟，出水水質穩定、設備初期投入低；

2、由于制水原理類同于用酸堿置換水中離子，所以在原水低含鹽量的應用區域運行成本

較低。

缺點：

1、由于離子交換床閥門眾多，操作復雜煩瑣；

2、離子交換法自動化操作難度大，投資高；

3、需要酸堿再生，再生廢水必須經處理合格后排放，存在環境污染隱患；

4、細菌易在床層中繁殖，且離子交換樹脂會長期向純水中滲溶有機物；

5、在含鹽量高的區域，運行成本高。

反滲透法處理：

優點：

1、反滲透技術是當今較先進、穩定、有效的除鹽技術；

2、與傳統的水處理技術相比，膜技術具有工藝簡單、操作方便、易于自動控制、無污染、運行成本低等優點，特別是幾種膜技術的配合使用，再輔之經其他水處理工藝，如石英砂、活性炭吸附、脫氣、離子交換、殺菌等。

3、原水含鹽量較高時對運行成本影響不大

缺點：

1、預處理要求較高、初期投資較大。