水處理系統進水中存在各種形式可導致反滲透膜和納濾膜表面污染的物質，例如水合金屬氧化物、含鈣沉淀物、有機物及生物。

膜系統預處理的目的在于盡量減少膜表面的上述污染，通過安裝合適的預處理系統，選擇恰當的操作條件，如產水量，運行壓力與產水回收率等，就能達到這一目標。

下列因素有可能引起膜系統污垢：

1、預處理系統不完善

2、預處理運行不正常

3、系統選材不合適

4、預處理投藥系統失靈

5、系統停機后沖洗不及時或不充分

6、操作控制不當

7、膜面長時間累積沉淀物

8、進水組份或其他條件改變

9、進水受生物污染

發生膜表面的污垢將加速系統性能的下降，如減少摻水流量，降低脫鹽率。污垢的另一個負面現象是進水和濃水間的壓差增加。

針對特定的污染，只有及時采取相應的清洗方法，才能達到好的效果，若錯誤地選擇清洗化學藥品和方法，有時會使膜系統污染加劇。因此，在清洗之前需先決定膜表面的污垢種類。

1、分析系統性能數據

2、分析進水組成，發生污垢的可能性或許經過分析原水水質報告，就能顯而易見的發現

3、檢查前幾次的清洗效果

4、分析測定SDI值的微孔濾膜膜面上所截留的污物

5、分析保安濾器芯上的沉積物

6、檢查進水管內表面積膜元件的進出水端面，如為紅棕色，則表示可能已發生鐵的污染；泥狀或膠狀沉積物通常為微生物或有機物污染。