膠體和顆粒污堵可嚴重影響反滲透和納濾元件的性能，而介質過濾器可以除去顆粒、懸浮物和膠體，這是基于當水流流過過濾介質的床層時，顆粒、懸浮物和膠體會附著在過濾介質的表面。過濾出水水質取決于雜質和過濾介質的大小、表面電荷和形狀、原水組成和操作條件等，設計和操作合理的 話，通常經過介質過濾器處理就可以達到SDI15功。

水處理系統最常用的過濾介質是石英砂和無煙煤，細砂過濾器石英砂顆粒有效直徑為0.35~0.5mm,無煙煤過濾器顆粒有 效直徑為0.7?0.8mm,當采用石英砂上填充無煙煤的雙介質過濾器時，它允許懸浮物等雜質進入過濾層內部，產生更有效的 深層過濾而延長清洗間隔。過濾介質的最小設計總床層深度為0.8m,在雙介質過濾器中，通常填充0.5m高的石英砂和0.4m 高的無煙煤。

有兩種形式的過濾器，重力過濾和壓力過濾。因為壓力濾器筒體可耐壓，能用較高的過濾床層、較精細的過濾介質粒徑 和較高的過濾濾速，設計過濾流速通常小于10~20m/h,反洗流速40~50m/h。對高污染傾向的原水（如地表水、受污染的井水或廢水），過濾流速必須小于10m/h (—般為5m/h)或采用二級介質過濾器。操作過程中，待過濾的原水進入濾器頂部，滲濾透過濾層，進入底部的集水系統，當壓力式濾器進出口間壓差增加0.3~0.6bar,重力式濾器壓差增加1.4mH2O時，先反洗和然后正洗濾器以除去沉積物，反洗一般需要10分鐘以上，大直徑的濾器還須設置輔助氣源擦洗。必須避免頻繁地開機和停機，因為每次流速的急卻變化會將原先已沉積在介質上的物質又釋放出來。介質過濾的設計和操作運行細節可以在相關文獻中獲得。